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PCR檢測實驗引物退火溫度詳述

日期:2025-05-09 03:13
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摘要: 退火溫度決定PCR特異性與產(chǎn)量;溫度高特異性強,但過高則引物不能與模板牢固結(jié)合,DNA擴增效率下降;溫度低產(chǎn)量高,但過低可造成引物與模板錯配,非特異性產(chǎn)物增加。一般先由37℃反應(yīng)條件開始,設(shè)置一系列對照反應(yīng),以確定某一特定反應(yīng)的zui適退火溫度。也可根據(jù)引物的(G+C)%含量進(jìn)行推測,把握試驗的起始點,一般試驗中退火溫度Ta(annealing temperature)比擴增引物的融解溫度TTm(melting temperature)低5℃,可按公式進(jìn)行計算: Ta = Tm - 5℃= 4(G+C)+ 2(A+T) -5℃   其中A,T,G,C分別表示相應(yīng)堿基的個數(shù)。例如,20個堿基...

    退火溫度決定PCR特異性與產(chǎn)量;溫度高特異性強,但過高則引物不能與模板牢固結(jié)合,DNA擴增效率下降;溫度低產(chǎn)量高,但過低可造成引物與模板錯配,非特異性產(chǎn)物增加。一般先由37℃反應(yīng)條件開始,設(shè)置一系列對照反應(yīng),以確定某一特定反應(yīng)的zui適退火溫度。也可根據(jù)引物的(G+C)%含量進(jìn)行推測,把握試驗的起始點,一般試驗中退火溫度Ta(annealing temperature)比擴增引物的融解溫度TTm(melting temperature)低5℃,可按公式進(jìn)行計算: Ta = Tm - 5℃= 4(G+C)+ 2(A+T) -5℃   其中A,T,G,C分別表示相應(yīng)堿基的個數(shù)。例如,20個堿基的引物,如果(G+C)%含量為50%時,則Ta的起點可設(shè)在55℃。在典型的引物濃度時(如0.2μmol/L),退火反應(yīng)數(shù)秒即可完成,長時間退火沒有必要。

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